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STR細(xì)胞鑒定意義

更新時(shí)間:2018-11-30      點(diǎn)擊次數(shù):2920

STR細(xì)胞鑒定意義

 

 

 

導(dǎo)讀:

新買(mǎi)到的細(xì)胞,實(shí)驗(yàn)室傳了幾代的細(xì)胞,又或者儲(chǔ)存于超低溫冰箱幾年不用的細(xì)胞,被污染了么? 鑒定正確么?用它做研究會(huì)影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果么? 沒(méi)有經(jīng)過(guò)相應(yīng)的細(xì)胞鑒定,使用了被污染的細(xì)胞,經(jīng)過(guò)大量的實(shí)驗(yàn),寫(xiě)出一篇論文,但是結(jié)論被推翻,論文被召回,大量的時(shí)間、物力和人力被浪費(fèi),一切都要從頭再來(lái)。

 

背景介紹

應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域的哺乳動(dòng)物細(xì)胞被錯(cuò)誤鑒定和交叉污染的問(wèn)題,一直是一個(gè)普遍存在的突出問(wèn)題。據(jù)統(tǒng)計(jì),國(guó)外實(shí)驗(yàn)室有20%左右的細(xì)胞株被錯(cuò)誤鑒定和交叉污染,NIH和ATCC近兩年都對(duì)此發(fā)出呼吁,要求研究者對(duì)細(xì)胞進(jìn)行鑒定。近年來(lái),大量研究表明STR基因分型方法是進(jìn)行細(xì)胞交叉污染和性質(zhì)鑒定的有效和準(zhǔn)確的方法之一,STR基因分型應(yīng)用于細(xì)胞鑒定已被ATCC等機(jī)構(gòu)強(qiáng)烈推薦。

細(xì)胞STR鑒定的必要性

在過(guò)去的45 人類乳突狀瘤病毒(人類乳頭狀瘤病毒18或HPV18)轉(zhuǎn)型成癌細(xì)胞的,而且和正常子宮頸細(xì)胞有許多不同。 據(jù)估計(jì),國(guó)外實(shí)驗(yàn)室已建株細(xì)胞有接近20%存在上述問(wèn)題。

2008年,約瑟芬Nefkens研究所的分子生物學(xué)家Winand13株食管腺癌細(xì)胞系中,其中3株:SEG-1,BIC-1和SK-GT-5被污染,這些細(xì)胞株混合有其他癌細(xì)胞。這些細(xì)胞系已經(jīng)被多家實(shí)驗(yàn)室應(yīng)用在兩個(gè)臨床試驗(yàn)、并發(fā)表了超過(guò)100篇SCI文章,并申請(qǐng)了11個(gè)美國(guó)磚利,這一研究結(jié)果被發(fā)布在新一期的Journal of the National Cancer Institute(JNCI)。

2007 年 NIH發(fā)布了通知,強(qiáng)烈建議在使用培養(yǎng)細(xì)胞的時(shí)候進(jìn)行鑒定(authentication)。2008 年底,專家提議ATCC致力于人源細(xì)胞系的鑒定工作,并制定鑒定的標(biāo)準(zhǔn)程序。

近年來(lái),大量研究表明 STR 基因分型方法是進(jìn)行細(xì)胞交叉污染和性質(zhì)鑒定的有效和準(zhǔn)確的方法之一,STR基因分型應(yīng)用于細(xì)胞鑒定已被ATCC等機(jī)構(gòu)強(qiáng)烈推薦。美國(guó)的ATCC 細(xì)胞庫(kù)、德國(guó)的DSMZ細(xì)胞庫(kù)以及日本的JCRB細(xì)胞庫(kù)等為STR 分型提供了各細(xì)胞株的數(shù)據(jù)供比對(duì)。

2011年初,美國(guó)菌種保藏中心(ATCC)制定了人源細(xì)胞系STR鑒定標(biāo)準(zhǔn),旨在約束因細(xì)胞交叉污染和錯(cuò)誤辨識(shí)所導(dǎo)致的無(wú)效科研數(shù)據(jù)的不斷擴(kuò)增。更重要的是,細(xì)胞系的鑒定在研發(fā)基于細(xì)胞下的醫(yī)學(xué)產(chǎn)品時(shí)起到至關(guān)重要的作用,它能避免將人體細(xì)胞暴露于錯(cuò)誤鑒定細(xì)胞中的風(fēng)險(xiǎn)。

 

細(xì)胞STR鑒定方法

要求能提供細(xì)胞的一般和特殊的生物學(xué)性狀指標(biāo)。一般特性指標(biāo)包括:細(xì)胞的一般形態(tài)、特異性結(jié)構(gòu)、細(xì)胞生長(zhǎng)曲線和分裂指數(shù)、倍增時(shí)間、接種率、染色體分析、同工酶檢查、DNA指紋圖譜等。特異性指標(biāo)常依據(jù)細(xì)胞種類和功能的特異性進(jìn)行鑒定,比如,若為腺細(xì)胞則一般鑒定是否有特殊產(chǎn)物包括分泌蛋白或激素產(chǎn)生;若為腫瘤細(xì)胞,還應(yīng)能夠證明細(xì)胞確系來(lái)源于腫瘤組織而非其它,并仍保留有腫瘤組織的特性,為此常需做集落形成實(shí)驗(yàn)、裸鼠致瘤實(shí)驗(yàn)以及對(duì)正常組織的侵襲實(shí)驗(yàn)等。

 

一、對(duì)正常細(xì)胞系的鑒定

對(duì)正常細(xì)胞系的鑒定主要圍繞以下四個(gè)方面進(jìn)行:(1)鑒定細(xì)胞的種系來(lái)源:常用方法主要有染色體分析、同工酶分析、DNA指紋圖譜等技術(shù)。(2)鑒定細(xì)胞的組織來(lái)源:可通過(guò)形態(tài)學(xué)手段、檢測(cè)組織特異性抗原等進(jìn)行鑒定。(3)細(xì)胞是否發(fā)生轉(zhuǎn)化和惡變:主要通過(guò)核型分析、細(xì)胞生長(zhǎng)行為觀察(是否喪失接觸抑制)、裸鼠成瘤實(shí)驗(yàn)等進(jìn)行鑒定。(4)細(xì)胞有無(wú)發(fā)生交叉污染,主要通過(guò)同工酶及DNA指紋圖譜技術(shù)進(jìn)行鑒定。

 

二、對(duì)腫瘤細(xì)胞系的鑒定

對(duì)腫瘤細(xì)胞系的鑒定主要圍繞其惡型性展開(kāi),染色體的異常、接觸抑制和密度依賴生長(zhǎng)特性的改變、集落形成能力、裸鼠成瘤、動(dòng)物體內(nèi)的侵襲生長(zhǎng),以及某些基因、分子水平的特征均是腫瘤細(xì)胞鑒定的方向。

 

細(xì)胞STR鑒定的意義

由于細(xì)胞培養(yǎng)體系在生物藥物的研究和技術(shù)發(fā)展中非常重要,適當(dāng)?shù)募?xì)胞系鑒定過(guò)程即成為每個(gè)研究人員的大興趣點(diǎn)。然而,交叉污染的問(wèn)題仍然存在。隨著世界范圍內(nèi)實(shí)驗(yàn)室使用新細(xì)胞系的數(shù)量增多和頻率增加,在質(zhì)量控制(如:細(xì)胞系鑒定)的基本原則上產(chǎn)生了巨大的差別。從已經(jīng)發(fā)表的、使用"錯(cuò)誤"的細(xì)胞系而導(dǎo)致可疑性結(jié)果的研究論文,到用于臨床的干細(xì)胞系和其它細(xì)胞系,交叉污染影響到了科學(xué)研究的每個(gè)領(lǐng)域-從實(shí)驗(yàn)臺(tái)到臨床。如果在細(xì)胞培養(yǎng)的處理和操作中不進(jìn)行重大變革,那么交叉污染將會(huì)成為一個(gè)更大、更嚴(yán)重的問(wèn)題。

細(xì)胞培養(yǎng)體系在生物研究和藥物研究發(fā)展中非常重要,隨著研究的深入,細(xì)胞系的種類也逐漸增多,而細(xì)胞系的交叉污染仍然存在。交叉污染給實(shí)驗(yàn)研究帶來(lái)了很嚴(yán)重的問(wèn)題,如果使用了錯(cuò)誤的細(xì)胞系使研究的結(jié)果遭到質(zhì)疑,前期的實(shí)驗(yàn)可能都要重新來(lái)做。因此對(duì)細(xì)胞系的認(rèn)證是有必要的。

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